全民奇迹精灵的技能种类主要分为基础技能和特殊技能两大类，每种技能在战斗中都能发挥独特作用。基础技能直接提升精灵的攻击力、防御力或生命上限等基础属性，而特殊技能则会在特定条件下触发额外效果，例如提高闪避率或造成范围伤害。精灵技能的品质分为白、蓝、紫、橙四种，品质越高附加属性越强，橙色品质技能还能为角色提供守护功能。
精灵技能的获取主要通过技能领悟系统实现，消耗精灵之星或钻石进行领悟，领悟等级越高获得高品质技能的几率越大。每个精灵最多可装配6个基础技能和2个特殊技能，基础技能数量与精灵等级相关，特殊技能则取决于精灵星级。特殊技能往往能大幅改变战斗局势，例如R级精灵波塞冬的特殊技能减攻，在死亡时会对范围内目标造成伤害并降低其攻击力。
精灵技能还包含独特的附能天赋和绝技天赋系统。附能天赋是被动效果，在出战或守护时为角色提供属性加成；绝技天赋则相当于主动技能，需要玩家手动释放。当角色达到一定等级后，可同时出阵3只精灵，需要考虑精灵之间的技能搭配效果，合理的组合能产生强大的羁绊加成，例如黄金幼龙和狮鹫的组合可为角色提供12%生命加成。
技能升级是提升战力的重要途径，消耗低级技能和经验粉尘可增强技能效果。建议优先升级优势技能以达到战力最大化，同时注意保留资源用于后期获得的高品质精灵。精灵重生系统允许将已升级精灵重置并返还全部消耗材料，这为玩家尝试不同技能组合提供了便利。
近战职业更适合选择提供防御加成的技能，远程职业则可侧重输出型技能。部分特殊技能如极寒领域能造成范围伤害和冰冻效果，这类控制型技能在团队作战中尤为实用。游戏进程推进，玩家需要不断调整精灵技能配置以适应更高难度的挑战。
